The Landscape of Viral Expression and Host Gene Fusion and Adaptation in Human Cancer
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Larsson lab
Library statistics
Sequence libraries:
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Unique samples:
419
Unique tumors:
419
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0
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413
Reads per sample (mean):
184 million
Total reads:
77423 million
Assembled contigs (>400 nt):
12951
Longest contig-to-virus alignments (italic = <95% identity)
Tumor sample
(hover/click for info)
Normal sample
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Acanthamoeba polyphaga mimivirus
233
Assembled genome 3: Clover-like virus
415
Bathycoccus sp. RCC1105 virus BpV1
350
453
509
304
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
213
260
340
334
Clover yellow mosaic virus
203
Cyprinid herpesvirus 1
236
213
Emiliania huxleyi virus 86
341
265
373
473
341
341
372
383
717
341
341
250
341
341
341
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341
341
341
548
203
341
341
341
Human herpesvirus 1
222
222
Megavirus chiliensis
249
204
249
250
243
237
250
324
349
281
249
324
336
311
258
350
360
281
258
258
249
287
243
336
336
250
Molluscum contagiosum virus subtype 1
278
206
271
Murine osteosarcoma virus
417
Staphylococcus phage SA11
367
White clover mosaic virus
405
Inquiries can be addressed to
erik.larsson@gu.se