The Landscape of Viral Expression and Host Gene Fusion and Adaptation in Human Cancer
 Online Supplementary Resource
About | Results | Larsson lab

Library statistics

Sequence libraries:238
Unique samples:237
Unique tumors:220
Unique normals:17
Unique patients:221
Reads per sample (mean):180 million
Total reads:42944 million
Assembled contigs (>400 nt):4189

Longest contig-to-virus alignments (italic = <95% identity)

Tumor sample(hover/click for info)
Normal sample

01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11
Acanthamoeba polyphaga mimivirus 488
Acanthocystis turfacea Chlorella virus 1 326 529 470 236 422
Bathycoccus sp. RCC1105 virus BpV1 297 752 621 900 689 1248
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1 382 393 510 528
Cyprinid herpesvirus 3 311 311 311
Emiliania huxleyi virus 86 341 250 341 341 250 341
Equid herpesvirus 2 305
Megavirus chiliensis 282 246 245 255
Micromonas sp. RCC1109 virus MpV1 388
Molluscum contagiosum virus subtype 1 411 380 402
Murine osteosarcoma virus 416 403 418 403 358 408
Ostreococcus tauri virus 1 228
Saimiriine herpesvirus 2 238



Inquiries can be addressed to erik.larsson@gu.se