The Landscape of Viral Expression and Host Gene Fusion and Adaptation in Human Cancer
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Larsson lab
Library statistics
Sequence libraries:
519
Unique samples:
519
Unique tumors:
453
Unique normals:
66
Unique patients:
462
Reads per sample (mean):
177 million
Total reads:
91803 million
Assembled contigs (>400 nt):
4680
Longest contig-to-virus alignments (italic = <95% identity)
Tumor sample
(hover/click for info)
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Acanthocystis turfacea Chlorella virus 1
469
Ateline herpesvirus 3
394
316
Cotesia congregata bracovirus segment Circle31
340
Cotesia congregata virus segment Circle7
311
Cyprinid herpesvirus 3
274
Emiliania huxleyi virus 86
208
203
341
341
Equid herpesvirus 2
207
Hepatitis B virus
842
Human papillomavirus type 18
1933
Micromonas sp. RCC1109 virus MpV1
473
Murine type C retrovirus
573
Inquiries can be addressed to
erik.larsson@gu.se