The Landscape of Viral Expression and Host Gene Fusion and Adaptation in Human Cancer
Online Supplementary Resource
About
|
Results
|
Larsson lab
Library statistics
Sequence libraries:
345
Unique samples:
341
Unique tumors:
304
Unique normals:
37
Unique patients:
304
Reads per sample (mean):
173 million
Total reads:
59715 million
Assembled contigs (>400 nt):
1928
Longest contig-to-virus alignments (italic = <95% identity)
Tumor sample
(hover/click for info)
Normal sample
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
01
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
11
Acanthamoeba polyphaga mimivirus
532
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
361
Emiliania huxleyi virus 86
341
Human herpesvirus 1
4265
Human herpesvirus 4
541
Human herpesvirus 4 type 1
450
Human papillomavirus type 16
1800
840
1576
841
1178
745
1445
1397
1336
569
841
841
841
769
721
1178
841
1454
1875
841
1161
769
1178
547
1454
801
1791
1178
1014
841
841
841
783
1736
Human papillomavirus type 33
936
863
1281
1853
2580
1133
Human papillomavirus type 56
1504
Megavirus chiliensis
218
Inquiries can be addressed to
erik.larsson@gu.se