The Landscape of Viral Expression and Host Gene Fusion and Adaptation in Human Cancer
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Larsson lab
Library statistics
Sequence libraries:
169
Unique samples:
167
Unique tumors:
167
Unique normals:
0
Unique patients:
161
Reads per sample (mean):
135 million
Total reads:
22833 million
Assembled contigs (>400 nt):
5095
Longest contig-to-virus alignments (italic = <95% identity)
Tumor sample
(hover/click for info)
Normal sample
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02
Acanthamoeba polyphaga mimivirus
235
250
268
552
268
268
Bathycoccus sp. RCC1105 virus BpV1
334
279
734
655
385
428
412
390
401
586
478
493
676
530
710
411
476
693
388
312
391
412
695
595
693
354
597
472
900
1088
621
622
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
224
224
387
260
401
260
410
Camelpox virus
464
473
471
Diadromus pulchellus ascovirus 4a
217
217
Emiliania huxleyi virus 86
407
225
Helicoverpa zea nudivirus 2
258
Human herpesvirus 4
201
Megavirus chiliensis
383
256
480
256
256
282
467
256
582
494
467
467
525
256
Molluscum contagiosum virus subtype 1
491
444
236
464
419
389
524
492
Murine osteosarcoma virus
403
385
435
408
418
418
298
418
359
403
407
408
Orf virus
254
Rous sarcoma virus
357
Saimiriine herpesvirus 2
238
238
238
238
238
238
Y73 sarcoma virus
318
415
467
307
523
Inquiries can be addressed to
erik.larsson@gu.se