The Landscape of Viral Expression and Host Gene Fusion and Adaptation in Human Cancer
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Library statistics

Sequence libraries:279
Unique samples:279
Unique tumors:249
Unique normals:30
Unique patients:261
Reads per sample (mean):182 million
Total reads screened:50662 million
Total viral alignments:935

Viral hits in ppm (parts-per-million) of total library reads

Tumor sample(hover for info)
Normal sample

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Non-normalized read counts

01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 01 06 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11
Abelson murine leukemia virus 1 1 1 1 1
Alfalfa mosaic virus RNA 1 3 10
Alfalfa mosaic virus RNA 3 2
Assembled genome 2: Mosaic-like virus 4
Autographa californica nucleopolyhedrovirus 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 2 4 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 4 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 5 1 3 3 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 3 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 2 2
Bell pepper endornavirus 2
Bombyx mandarina nucleopolyhedrovirus 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1
Bombyx mori NPV 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1
Bovine polyomavirus 9 14
Bovine viral diarrhea virus 1 1 1 1 1 1
Brome mosaic virus RNA 1 1 1 2
Brome mosaic virus RNA 2 1 1
Brome mosaic virus RNA 3 1 1
Clover yellow mosaic virus 1
Deformed wing virus 2
Encephalomyocarditis virus 2
Feline leukemia virus 1
Friend murine leukemia virus 1 2
Hepatitis B virus 1 4 2
Human herpesvirus 4 2 2
Human herpesvirus 4 type 1 2 2
Human herpesvirus 5 1 2
Human immunodeficiency virus 1 2 1
Human papillomavirus - 2 2
Human papillomavirus type 16 3
Human papillomavirus type 18 4 7 2
Human papillomavirus type 31 6
Human papillomavirus type 45 1
Kakugo virus 1
Lucerne transient streak virus 2
Maruca vitrata MNPV 1 1 1 1 1
Merkel cell polyomavirus 2 2 6
Mirafiore lettuce virus RNA 2 2
Mirafiore lettuce virus RNA 3 1
Moloney murine leukemia virus 4 1 1 1 3 1 1
Moloney murine sarcoma virus 4 1 1 3 1 1
Murine osteosarcoma virus 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1
Murine type C retrovirus 1 2
Oat necrotic mottle virus 1
Papaya ringspot virus 1
Pepper mild mottle virus 8
Pestivirus Giraffe-1 1 1 1 1 1
Plutella xylostella multiple nucleopolyhedrovirus 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 2 4 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 4 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 5 1 3 3 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 3 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 2 2
Polyomavirus HPyV6 1
Polyomavirus HPyV7 2
Porcine endogenous retrovirus E 1 1
PreXMRV-1 provirus 1 1 2
Rachiplusia ou MNPV 2 1 1 1 1 3 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 3 1 1 1 1 2 1 1 1
Rauscher murine leukemia virus 1 2
Shamonda virus segment S 1 1 2 2 2 1 1 5 4 1 1 1 2 2 1 1 11 1 13 2 36 1 1 13 1 41 3 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 3 1 1 2 12 1 2 1 2 2 1 36 8 1 3 3 1 1 1 3 1 1 3 1 1 4 1 3 1 1 1 3 1 2 2 18 2 3 5 3 1 1 2 3 1 2 3 1 1 1 1
Simian adenovirus 49 1
Simian virus 40 2
Simian-Human immunodeficiency virus 1
Spodoptera litura granulovirus 2 2 2
Tobacco mosaic virus 4
Tobacco ringspot virus RNA 2 2
Tomato mosaic virus 4 2
Turnip vein-clearing virus 1
Watermelon mosaic virus 1
White clover mosaic virus 1
Woolly monkey sarcoma virus 1



Inquiries can be addressed to erik.larsson@gu.se