The Landscape of Viral Expression and Host Gene Fusion and Adaptation in Human Cancer
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Reads per sample (mean):184 million
Total reads screened:77423 million
Total viral alignments:6854

Viral hits in ppm (parts-per-million) of total library reads

Tumor sample(hover for info)
Normal sample

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Human herpesvirus 4 1
Human herpesvirus 4 type 1 2

Non-normalized read counts

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Abelson murine leukemia virus 1 2 1 1 2 1 1
Acanthamoeba polyphaga mimivirus 2
Alfalfa mosaic virus RNA 3 1
Assembled genome 3: Clover-like virus 27
Autographa californica nucleopolyhedrovirus 2 2 4 8 4 4 2 2 2 2 10 4 14 3 2 4 10 2 1 2 8 6 10 2 8 2 4 12 9 10 14 4 15 15 1 4 2 4 2 2 5 2 6 4 9 4 2 4 2 8 2 4 2 2 4 4 2 3 2 9 4 5 4 2 12 4 10 12 10 6 2 8 1 2 4 2 4 6 8 6 2 7 4 2 2 5 10 2 10 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5 6 2 3 5 6 6 6 2 3 8 2 8 2 8 4 2 2 2 2 4 3 2 2 4 2 2 4 2 2 4 6 5 8 4 4 6 6 6 2 4 2 3 2 12 7 2 2 1 3 2 2 2 2 9 2 2 1 2 6 6 2 12 2 2 4 6 2 2 8 2 2 4 4 2 3 4 6 2 1 4 6 4 4 2 6 2 2 4 2 4 2 4 4 2 2 2 2 2 6 7 2 4
Avian carcinoma virus 3
Avian endogenous retrovirus EAV-HP 4 2
Avian leukemia virus 4 4 6 1 2
Avian leukosis virus - RSA 2 4 4 6 1 2
Avian myelocytomatosis virus 3
Bombyx mandarina nucleopolyhedrovirus 2 4 1 2 4 4 1 6 2 4 1 2 1 2 3 4 5 10 4 8 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 1 3 1 3 2 1 6 2 5 8 3 3 2 1 1 2 1 4 2 3 1 1 10 2 1 1 1 2 2 1 1 3 1 2 2 2 1 6 1 2 3 3 1 1 1 4 2 2 2 4 2 2 1 6 2 1 1 2 4 2 1 6 2 1 3 1 3 2 2 3 1 1 5 1 2 5 2 2 2 4 2 2 2 4 2 2
Bombyx mori NPV 2 4 1 1 1 4 4 1 6 2 4 1 2 1 1 4 4 5 10 2 7 1 1 2 1 2 2 2 1 4 2 1 1 3 1 3 2 1 2 6 1 5 8 3 4 2 1 1 3 4 2 2 3 1 1 10 2 2 1 1 2 2 1 1 3 1 2 2 2 1 5 1 3 3 1 1 1 4 2 2 2 4 2 2 1 6 2 1 1 1 7 3 1 6 2 1 3 1 3 2 3 1 1 4 1 2 4 2 1 1 4 1 2 2 1 4 2 2
Bovine viral diarrhea virus 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1
Brome mosaic virus RNA 1 4
Brome mosaic virus RNA 2 1
Canine parvovirus 10
Cauliflower mosaic virus 2 8 2 2 2
Cereal yellow dwarf virus-RPS 1
Clover yellow mosaic virus 4 2 2 3
Cucumber mosaic virus RNA 3 1
Encephalomyocarditis virus 6 1 2
Friend murine leukemia virus 6 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 3 1 1 1 2
Human herpesvirus 4 1 2 1 4 8 370 1 1
Human herpesvirus 4 type 1 1 1 1 4 8 552 1 1
Human herpesvirus 6B 4
Human herpesvirus 7 8 36 4 2
Human immunodeficiency virus 1 1
Human papillomavirus - 1 2 2
Human papillomavirus type 128 2 2
Human papillomavirus type 135 2
Human papillomavirus type 18 1 73 62 2 37 2 2 63 16 6
Human papillomavirus type 4 2 4 2
Human papillomavirus type 49 2
Human papillomavirus type 50 1
Human papillomavirus type 56 2
Human papillomavirus type 63 2
Human papillomavirus type 88 2
Human papillomavirus type 9 2
Human papillomavirus type 92 2
Lettuce chlorosis virus RNA2 4
Lolium latent virus 2
Macacine herpesvirus 4 4
Maruca vitrata MNPV 2 1 1 1 2
Merkel cell polyomavirus 3 39 2 2 4 2 2 4 1 2 2 14 2 6 2 7 2 4 22 2 2 2 1 8 2 2 2 2
Molluscum contagiosum virus subtype 1 1
Moloney murine leukemia virus 2 2 3 8 4 3 8 2 4 4 4 2 2 4 2 5 4 1 2 2 12 2 2 2 1 2 6 2 4 1 1 2 1 10 2 2 2 2 2 2 2
Moloney murine sarcoma virus 2 2 4 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2
Murine osteosarcoma virus 3 2 2 3 2 2 1 1 1 1 3 2 1 2 3 1 1 2 1 1 1 1 2 3 1 1 3 1 2 4 3 2 3 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 4 1 1 1 3 1 2 1 2 3 1 1 2 1 1 1 1 3 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1
Murine type C retrovirus 2 2 2 2 3 1 2 6 1 1 1
Penicillium chrysogenum virus segment 3 1
Pepino mosaic virus 10 2 1 2
Pepper mild mottle virus 2
Pestivirus Giraffe-1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1
Plutella xylostella multiple nucleopolyhedrovirus 2 1 4 8 3 4 2 2 2 2 8 4 12 1 2 4 10 2 1 8 4 6 2 4 2 4 12 8 10 14 4 15 15 1 4 2 2 1 1 5 2 6 4 9 2 1 4 2 5 4 2 2 2 4 2 3 2 9 4 6 2 2 12 4 10 10 10 5 2 8 1 2 4 2 4 6 8 6 2 7 4 2 1 10 2 10 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5 6 2 4 6 6 6 3 2 3 8 2 8 2 8 4 2 2 2 2 4 3 2 2 2 2 4 4 2 4 6 4 8 4 3 6 6 6 2 4 2 3 12 7 2 2 1 3 2 2 2 2 7 2 1 2 6 6 2 9 2 2 4 6 2 2 7 2 2 4 4 2 3 4 6 1 3 6 4 4 2 6 2 2 4 2 4 1 4 4 2 2 2 2 2 4 5 2 2
Polyomavirus HPyV7 2
Porcine endogenous retrovirus E 2 1
PreXMRV-1 provirus 2 2 2 4 1 2 5 1 4 2
Pseudaletia unipuncta granulovirus 1
RD114 retrovirus 2 8
Rachiplusia ou MNPV 2 1 4 3 1 2 1 5 2 10 1 1 10 1 2 1 2 2 4 3 6 2 5 2 4 2 2 1 2 2 4 3 1 7 2 2 1 1 1 3 3 2 4 4 5 4 2 2 2 1 1 2 1 2 4 2 1 1 2 2 1 3 6 1 5 2 2 2 1 5 4 1 1 3 1 2 5 1 5 6 1 2 1 2 2 1 1 3 2 5 2 4 2 5 2 2 1 12 4 2 1 2 1 1 2 1 2 3 1 5 1 1 2 2 4 1 1 1 1 2 1 4 2 2 5 2 2 2 2 1 1 1 1 1 3 2 2
Rauscher murine leukemia virus 4 2 1 3 1 2 2 1 2 3 2 1 2 1 5 1 1 2 2
Rous sarcoma virus 2 4 4 6 2 2
Ryegrass mosaic virus 2
Shamonda virus segment S 2 35 5 2 6 5 2 4 2 6 4 2 4 7 15 1 11 6 1 3 2 1 5 16 2 5 2 1 23 4 3 2 4 1 4 1 1 9 4 1 4 48 3 1 4 13 3 42 19 1 5 9 5 23 10 27 7 17 18 1 12 10 18 1 2 4 17 16 2 9 5 6 4 2 1 4 2 3 6 6 2 9 3 1 1 5 3 2 1 5 5 4 5 2 1 6 2 1 6 5 3 4 1 2 3 1 3 8 3 4 1 20 1 7 2 2 5 7 25 7 9 2 16 1 4 2 6 2 2 6 2 6 5 5 6 7 3 2 2 4 15 3 5 3 18 8 2 5 5 1 2 6 4 9 4 6 7 12 3 5 14 2 5 7 6 10 7 5 1 9 4 1 5 11 9 2 7 1 2 2 6 3 3 3 9 2 4 1 11 10 1 8 2 7 4 2 10 3 9 2 6 10 2 7 3 1 4 2 2 2 4 1 4 1 5 1 2 5 5 4 7 1 9 4 4 2 1 1 4 2 1 7 5 1 3 1 16 5 3 8 3 4 2 1 5 3 15 11 5 3 3 4 3 1 1 4 2 1 3 1 10 4 6 6 2 3 7 4 9 6 1 7 3 1 3 7 5 2 2 5 3 8 8 2 2 4 4 11 2 2 2 7 3 4 3 12 2 3 2 1 10 2 2 1 3 3 8 1 3 2 9 9 4 5 6 3 3 13 5 6 8 7 6 7 3 5 10 1 5 1 3 2 2 9 2 3 5 1 4 6 2 1 1 1 2 1 9 4 2 1 5 3 1 3 5 6 1 3 6 2 4 5 1 5 1 2 2 2 2 3 30 3 10 2
Simbu virus segment L 1
Spleen focus-forming virus 4 1 1 2
Staphylococcus phage SA11 1
Tobacco etch virus 2 2 4 2
Tobacco mosaic virus 1 2
Tomato mosaic virus 1
White clover mosaic virus 3 9 4 1 140 2
Woolly monkey sarcoma virus 1 1 1 1 1 1 1
Y73 sarcoma virus 1 1



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